В течение двух лет богослужения совершались в маленьком деревянном домике, обустроенном под храм. 9 августа 1999 года в день памяти великомученика Пантелеимона были забиты первые сваи под строительство нового кирпичного храма. Строительство храмового здания было окончено в конце 2003 года. Еще в течение полутора лет в храме совершались отделочные работы и велась роспись стен. Торжественное освящение храма состоялось 16 октября 2005 года архиепископом Кемеровским и Новокузнецким Софронием (Будько) и епископом Прокопьевским Амвросием (Ермаковым), викарием Кемеровской и Новокузнецкой епархии.

Первый монашеский постриг в истории обители был совершен епископом Кемеровским и Новокузнецким Аристархом 11 апреля 2008 года по окончании вечернего богослужения в честь праздника Похвалы Пресвятой Богородицы.

В настоящее время монастырь имеет свое подсобное хозяйство. При обители с 2008 года действует детская воскресная школа, а в 2012 году открыта воскресная школа для взрослых. В середине октября 2012 г. запущен в эксплуатацию новый двухэтажный монастырский корпус. На первом этаже нового здания расположены кабинеты воскресной школы, трапезная, библиотека, кабинет настоятеля. Второй этаж полностью занимают жилые братские кельи. Строительство нового здания позволило увеличить количество мест для проживания в монастыре, а также создать комфортные условия для обучения детей и взрослых в воскресной школе. 16 сентября 2014 года в районе деревни Краснознаменка Новокузнецкого района на месте исторического подвига преподобных Зосимы (Верховского), Василиска Сибирского, а также праведного Петра Томского, состоялось освящение закладного камня под строительство храма в честь этих святых. Чин освящения совершал Преосвященнейший Владимир, епископ Новокузнецкий и Таштагольский. На этом месте в октябре месяце нынешнего года планируется начало строительства скита Свято-Пантелеимонова мужского монастыря.